Η πλήρης γονιδιακή ανάλυση των BRCA1 και BRCA2 με χρήση αλληλούχισης επόμενης γενιάς (NGS) και της ενίσχυσης ανιχνευτή εξαρτώμενης από πολυπλεξία (MLPA) χρησιμοποιείται σε συνδυασμό για την ανάλυση των γονιδίων BRCA1 και BRCA2 επειδή παρέχει συμπληρωματικές πληροφορίες:
- Το NGS παρέχει ολοκληρωμένη αλληλούχιση ολόκληρων των γονιδίων, επιτρέποντας την ανίχνευση σημειακών μεταλλάξεων και άλλων μικρών γενετικών παραλλαγών. Αυτό είναι κρίσιμης σημασίας για τον εντοπισμό παθογόνων μεταλλάξεων στις περιοχές κωδικοποίησης και στις ρυθμιστικές περιοχές αυτών των γονιδίων.
- Το MLPA επικεντρώνεται στην ανίχνευση μεγάλης κλίμακας διαγραφών ή διπλασιασμών στα γονίδια. Ενώ το NGS είναι εξαιρετικό για τον εντοπισμό σημειακών μεταλλάξεων, το MLPA είναι πιο αποτελεσματικό στον εντοπισμό δομικών αλλαγών στα γονίδια, γεγονός που μπορεί επίσης να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου.
Με τη χρήση τόσο του NGS όσο και του MLPA, επιτυγχάνεται μια πληρέστερη και ακριβέστερη αξιολόγηση των γονιδίων BRCA1 και BRCA2, βοηθώντας τους ειδικούς να κάνουν πιο ακριβείς εκτιμήσεις του κινδύνου και εξατομικευμένες συστάσεις για τους ασθενείς και τις οικογένειές τους.
Τα BRCA1 και BRCA2 είναι γονίδια που παίζουν κρίσιμο ρόλο στην ανάπτυξη καρκίνων του μαστού και των ωοθηκών. Οι μεταλλάξεις σε αυτά τα γονίδια σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης αυτών των καρκίνων. Όταν τα άτομα έχουν οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του μαστού ή των ωοθηκών ή άλλους παράγοντες κινδύνου, μπορούν να υποβληθούν στη συγκεκριμένη γενετική εξέταση προκειμένου να εκτιμηθεί εάν φέρουν μεταλλάξεις σε αυτά τα γονίδια.
Το NGS (Next-Generation Sequencing) και το MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) είναι δύο προηγμένες τεχνικές μοριακής βιολογίας που χρησιμοποιούνται στον γενετικό έλεγχο, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης των γονιδίων BRCA1 και BRCA2.
NGS (αλληλούχιση επόμενης γενιάς)
- Το NGS είναι μια τεχνολογία αλληλούχισης DNA υψηλής απόδοσης που μπορεί να αναλύσει πολλαπλά γονίδια ταυτόχρονα.
- Στο πλαίσιο της ανάλυσης των γονιδίων BRCA1 και BRCA2, το NGS μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την αλληλούχισης αυτών των γονιδίων και τον εντοπισμό τυχόν μεταλλάξεων ή παραλλαγών.
- Παρέχει πλήρη αλληλούχιση ολόκληρου του γονιδίου ή συγκεκριμένων περιοχών ενδιαφέροντος εντός του γονιδίου.
- Το NGS μπορεί να ανιχνεύσει διάφορους τύπους γενετικών αλλαγών, συμπεριλαμβανομένων σημειακών μεταλλάξεων, εισαγωγών, διαγραφών και επαναλήψεων.
- Είναι ιδιαίτερα ευαίσθητο και μπορεί να εντοπίσει μεταλλάξεις στις κωδικοποιητικές περιοχές των γονιδίων, στα όρια εσωνίου-εξονίου και σε άλλες ρυθμιστικές περιοχές.
- Το NGS μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την αλληλούχιση πολλαπλών γονιδίων που σχετίζονται με σύνδρομα κληρονομούμενου καρκίνου για να παρέχει μια πιο ολοκληρωμένη αξιολόγηση του κινδύνου εμφάνισης καρκίνου.
MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification)
- Το MLPA είναι μια τεχνική που χρησιμοποιείται για την ανίχνευση και τον ποσοτικό προσδιορισμό των μεταβολών του αριθμού αντιγράφων (CNV) σε συγκεκριμένες αλληλουχίες DNA.
- Στο πλαίσιο της ανάλυσης BRCA1 και BRCA2, το MLPA μπορεί να εντοπίσει μεγάλης κλίμακας διαγραφές ή διπλασιασμούς εντός αυτών των γονιδίων, γεγονός που μπορεί επίσης να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου.
- Το MLPA περιλαμβάνει τη χρήση πολλαπλών ανιχνευτών που υβριδοποιούνται στις αλληλουχίες DNA στόχου, ακολουθούμενες από βήματα ενίσχυσης.
- Συγκρίνοντας τα αποτελέσματα με ένα δείγμα αναφοράς, το MLPA μπορεί να προσδιορίσει εάν υπάρχουν διαγραφές ή διπλασιασμοί στα γονίδια BRCA1 και BRCA2.
Ο συνδυασμός NGS και MLPA στην ανάλυση των γονιδίων BRCA1 και BRCA2 επιτρέπει μια ολοκληρωμένη αξιολόγηση των μεταλλάξεων και γενετικών παραλλαγών που μπορεί να αυξήσουν τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του μαστού και των ωοθηκών.
Δείτε επίσης: BRCA1 / BRCA2, Πλήρης Γονιδιακή Ανάλυση με NGS
