Η ισταμίνη είναι μια ενδογενής, βραχείας δράσης βιογενής αμίνη, που συντίθεται από το αμινοξύ ιστιδίνη και είναι ευρέως κατανεμημένη σε ολόκληρο το σώμα. Η ισταμίνη βρίσκεται αποθηκευμένη στα κοκκία των βασεόφιλων και των σιτευτικών κυττάρων και αποτελεί έναν σημαντικό μεσολαβητή των αλλεργικών αντιδράσεων άμεσου τύπου. Φυσιολογικά, υπάρχει μία ελάχιστη ποσότητα ισταμίνης στην κυκλοφορία του αίματος. Αυξήσεις στα επίπεδα της ισταμίνης στο πλάσμα και τους ιστούς, συμβαίνουν κατά τη διάρκεια της αναφυλαξίας και στις αλλεργικές αντιδράσεις του δέρματος και των αεραγωγών.
Η ισταμίνη ανήκει επίσης σε μια κατηγορία νευροδιαβιβαστών που ονομάζονται νευροδιαβιβαστές μικρού μοριακού βάρους. Αυτή η ομάδα περιλαμβάνει μόρια όπως η σεροτονίνη, η επινεφρίνη και η ντοπαμίνη.
Επιπλέον, η ισταμίνη παίζει ρόλο στην έκκριση του γαστρικού οξέος στο στομάχι, επάγοντας την παραγωγή του.